Le virus HHV-6 existe sous la forme de 2 sous-espèces, A et B, la seconde étant la plus fréquente. Ce virus ubiquitaire, mais n'infectant que l'homme, persiste à vie sous une forme latente à la suite d'une primo-infection contractée dans les 3 premières années de vie par contact salivaire. Il est également capable de persister sous une forme tout à fait originale, en s'intégrant au génome de l'hôte en zone subtélomérique, grâce à des séquences virales similaires à celles des télomères humains. Cette particularité, dont les conséquences physiopathologiques sont mal connues, concerne environ 1 % de la population et conduit à la présence de l'ADN viral dans au moins un allèle de toutes les cellules de l'individu. Cela complexifie le diagnostic des réactivations de HHV-6, qui, dans les suites d'allogreffes de cellules souches hématopoïétiques, peuvent conduire à des encéphalites graves.
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