Dossier

Microscopie digitale : applications en fluorescence

Mis en ligne le

29 mars 2019

Auteur

F.X. Frenois

L'imagerie fonctionnelle, et plus particulièrement les techniques d'immunofluorescence multiplex, jouent un rôle fondamental dans le diagnostic des cancers et la compréhension des mécanismes sous-jacents. Ces nouvelles techniques imposent l'utilisation de méthodes de microscopie en fluorescence pour l'acquisition à haute résolution d'images de tissus entiers, et génèrent une quantité très importante de données. Parallèlement à la renaissance de l'intelligence artificielle, ces sources de données massives permettent de déployer des stratégies de machine learning et de deep learning pour le développement d'outils d'analyse quantitative automatisée capables d'aider les pathologistes dans leur prise de décision. Le diagnostic est ainsi de plus en plus précis et la prise en charge du patient de plus en plus adaptée et personnalisée. Cet article a pour but de définir les spécificités de l'imagerie en mode fluorescence qui imposent de nouvelles contraintes aux systèmes d'imagerie de lames entières.

L'analyse histopathologique et l'imagerie fonctionnelle jouent aujourd'hui un rôle fondamental dans le diagnostic des cancers et de nombreuses autres pathologies. En particulier, la caractérisation précise des tumeurs par des techniques immunohistochimiques et moléculaires sur coupes de tissus, comme l'hybridation in situ en fluorescence (FISH) et l'immunofluorescence multiplex (1, 2), permet la validation fonctionnelle de cibles thérapeutiques et l'évaluation préclinique de la réponse à la chimiothérapie et à l'immunothérapie. Si le diagnostic est de plus en plus précis et la prise…