Approches moléculaires multiplex dans les gastroentérites

Les diarrhées d'origine communautaire ou survenant à l'hôpital représentent un enjeu diagnostique. La symptomatologie et l'anamnèse sont souvent insuffisantes. La mise en évidence d'un agent infectieux fait appel à de multiples techniques et expertises. De nouveaux outils moléculaires multiplex permettent désormais de rechercher les principaux agents pathogènes (bactéries, virus et protozoaires) en quelques heures dans un test unique. Ils permettent de détecter entre 8 et 25 % de pathogènes supplémentaires par rapport aux techniques conventionnelles. Ils pourraient simplifier l'analyse microbiologique des selles, et permettre une prescription plus adaptée des anti-infectieux, ainsi que la mise en oeuvre de mesures d'isolement. Il reste cependant difficile de distinguer les portages asymptomatiques des infections actives pour certains pathogènes. Le bénéfice médical et économique de l'usage de ces technologies doit être évalué en regard de la population étudiée et des infrastructures diagnostiques.