Dossier

Métagénomique clinique en 2021 : état des lieux et perspectives

Mis en ligne le
31 déc. 2021
Auteur
  • M. Salmona
  • C. d’Humières
  • E. Ruppé
  • La métagénomique clinique (MgC) est une méthode de diagnostic microbiologique basée sur le séquençage à haut débit.
  • La MgC permet de détecter l'ADN ou l'ARN de micro-organismes, quelle que soit leur nature (bactéries, virus, levures, champignons, parasites).
  • La MgC manque cependant de sensibilité, notamment dans les échantillons complexes et riches en cellules humaines (interférence avec l'ADN humain).
  • La MgC est également très sensible aux contaminations, notamment dans les échantillons dépourvus de micro-organismes (vrais négatifs).
  • La MgC est aujourd'hui une méthode prometteuse pour compléter, et non remplacer, les méthodes conventionnelles.
 

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Liens d'intérêt

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E. Ruppé déclare avoir des liens d’intérêts avec les sociétés PathoQuest et Illumina (consultant).

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