Le nombre de maladies relevant d'un mécanisme d'auto-immunisation et entrant donc dans le cadre nosologique des maladies auto-immunes est en constante augmentation. On en recense actuellement 80.
Ce fort accroissement est particulièrement notable dans le domaine de la neurologie où l'on est passé de rares maladies auto-immunes bien délimitées comme la myasthénie, à une explosion de nouvelles entités comme le PANDAS (Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric Disorders Associated with Streptococcal infections), décrit pour la première fois en 1998, ou les nouvelles encéphalites auto-immunes, dont le démembrement est toujours en cours et, très certainement, loin d'être terminé.